Я сталкивался:)
Да, если приложение представляет из себя постоянно работающий демон или скрипты, запущенные под mod_perl, то, если не заботиться о памяти, ее рано или поздно может и не хватить:) Так что нужно чистить самостоятельно с помощью undef и применять приемы из pdf, что ты прочел.